Η Φυσικομαθηματική Σχολή του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων ιδρύθηκε με το με το Ν.Δ. 746/1970 (Φ.Ε.Κ. 267/Α/12.12.1970) και περιλάμβανε το ιδρυθέν από το 1966 Τμήμα Μαθηματικών, καθώς και το νεοϊδρυθέν Τμήμα Φυσικής. Το 1977, εντάχθηκε στη Φυσικομαθηματική Σχολή το Τμήμα Χημείας με το Π.Δ. 723/1976 (Φ.Ε.Κ. 262/Α/06.10.1976). Η Σχολή Θετικών Επιστημών του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων δημιουργήθηκε με το Π.Δ. 128/1983 (Φ.Ε.Κ. 57/Α/03.05.1983) και περιλάμβανε τα Τμήματα Μαθηματικών, Φυσικής και Χημείας. Η Σχολή Θετικών Επιστημών ανασυγκροτήθηκε με το Π.Δ. 148/1990 (Φ.Ε.Κ. 56/Α/10.04.1990) για να ενσωματώσει το νέο Τμήμα Πληροφορικής. Με το Π.Δ. 105/2013 (Φ.Ε.Κ. 137/A/05.06.2013) και το σχέδιο «ΑΘΗΝΑ» ανασυγκροτήθηκε, εκ νέου, για να συμπεριλάβει το Τμήμα Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών και Πληροφορικής (ως μετεξέλιξη του Τμήματος Πληροφορικής) καθώς και το Τμήμα Μηχανικών Επιστήμης Υλικών (ως μετεξέλιξη του Τμήματος Επιστήμης και Τεχνολογίας Υλικών). Η Σχολή Θετικών Επιστημών έλαβε τη σημερινή της μορφή με το Ν. 4485/2017 (Φ.Ε.Κ. 114/Α/04.08.2017) και αποτελεί τη δεύτερη αρχαιότερη Σχολή ανάμεσα στις ένδεκα υφιστάμενες Σχολές του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων.

Σήμερα, η Σχολή Θετικών Επιστημών του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων περιλαμβάνει τα Τμήματα: